中/英文教程
下載免費(fèi)試用版和我們的其中一個(gè)教程，以交互方式掌握Geneious的功能。
Geneious
自動(dòng)標(biāo)注，實(shí)時(shí)序列分析和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
用我們?nèi)娴腄NA序列編輯工具對(duì)您的序列充滿(mǎn)信心。 編輯并注釋序列，然后將您的作品導(dǎo)出為可發(fā)布的圖像。
使用自動(dòng)注釋很容易發(fā)現(xiàn)
根據(jù)公共或本地?cái)?shù)據(jù)庫(kù)中的現(xiàn)有模式和注釋自動(dòng)注釋新基因組，包括將ORF注釋為基于這些模式和基于NCBI的查詢(xún)的假設(shè)基因。
- 用ORF標(biāo)注序列或用Glimmer預(yù)測(cè)基因
- 通過(guò)復(fù)制和粘貼序列搜索圖案
- 基于相似性的注釋?zhuān)ù笮托蛄袛?shù)據(jù)庫(kù)）
- 使用對(duì)齊方式傳輸注釋
- 用火衛(wèi)一檢測(cè)串聯(lián)重復(fù)
強(qiáng)大的SNP檢測(cè)和變異調(diào)用
在美麗的瀏覽器中導(dǎo)航讀取。 在序列查看器中手動(dòng)輕松識(shí)別，檢查和解決分歧，或快速注釋較大重疊群上的變異。 該功能可以配置為
- 通過(guò)查找高于最低閾值的分歧來(lái)屏幕讀取錯(cuò)誤。
- 僅在編碼區(qū)域找到分歧
- 確定變異對(duì)蛋白質(zhì)翻譯的影響，包括僅密碼子中第一個(gè)和第三個(gè)位置發(fā)生變化的變異
- 計(jì)算SNP正確的概率
- 消除高鏈偏倚的SNP
- 將您的變體導(dǎo)出到csv
- 搜索并注釋短的結(jié)構(gòu)變體，例如短串聯(lián)重復(fù)序列（STR）和插入和刪除事件（InDels）
實(shí)時(shí)序列預(yù)測(cè)
只需點(diǎn)擊幾下，您就可以找到您的序列，包括：
- DNA翻譯 - 翻譯和補(bǔ)充您的核苷酸序列。 一次翻譯任何一幀或全部6幀，或者只是翻譯您感興趣的注釋或選擇。
- 共有序列 -根據(jù)您選擇的身份方案，其中包括在其上會(huì)自動(dòng)選擇最佳的基地呼叫色譜數(shù)據(jù)“以質(zhì)量求共識(shí)”預(yù)測(cè)一致序列
- DNA序列 - 預(yù)測(cè)身份，讀取覆蓋率，有關(guān)基本頻率，殘基頻率，CpG島等的眾多統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)
- 蛋白質(zhì)序列 - 預(yù)測(cè)分子量，等電點(diǎn)，疏水性，跨膜區(qū)域，卷曲螺旋區(qū)域，氨基酸電荷等
在Geneious中的自動(dòng)標(biāo)注
視頻簡(jiǎn)介
應(yīng)用筆記
關(guān)于如何使用來(lái)自埃博拉病毒分離株的下一代測(cè)序數(shù)據(jù)在Geneious中生成SNPtree的概述。