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Geneious Biologics注釋算法擊敗IgBLAST,MiXCR

Geneious針對專業(yè)治療性抗體發(fā)現(xiàn)的強(qiáng)大生物信息學(xué)支持白皮書下載

周四,2018年5月3日,上午9:44

新聞稿:Geneious Biologics

MiXCR表示,Geneious Biologics注釋算法擊敗IgBLAST。

新西蘭奧克蘭 - 2018年5月2日 - 今天發(fā)布的白皮書顯示,針對抗體篩選和發(fā)現(xiàn)的商業(yè)軟件解決方案Geneious Biologics開發(fā)的注釋算法優(yōu)于開源序列分析軟件IgBLAST和MiXCR。

白皮書概述了為什么準(zhǔn)確的抗體序列注釋對于進(jìn)行治療性抗體研究的公司很重要。生物藥物開發(fā)涉及越來越多的抗體序列數(shù)據(jù)。這引入了圍繞準(zhǔn)確篩選大量候選序列的核心問題,短時間尺度內(nèi)以確定最有希望的、有用的。?

在一系列比較測試中,MiXCR 2.1.9,IgBLAST和Geneious Biologics注釋算法的任務(wù)是分析相同的數(shù)據(jù)集 - 美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)參考數(shù)據(jù)庫SRR5754964(Human)。

由于缺乏行業(yè)黃金標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)集,因此評估序列注釋的準(zhǔn)確性是困難的,然而,與IgBLAST和MiXCR相比,Geneious Biologics在注釋CDR區(qū)和生殖系基因方面的表現(xiàn)與三種算法的一致結(jié)果最相關(guān)。在Geneious Biologics不同意共識結(jié)果的極少數(shù)情況下,生物信息學(xué)家密切審查結(jié)果,并確定Geneious Biologics總體上是正確的,而MiXCR和I??gBLAST都不正確,表明Geneious Biologics相對于這些流行的開源工具具有優(yōu)越的性能。

白皮書作者兼Geneious Biologics Solutions副總裁Jannick Bendtsen博士說:“速度和準(zhǔn)確性對于進(jìn)行高度特異性研究以確定和驗(yàn)證潛在治療性抗體候選物的組織絕對重要。

“很少有現(xiàn)有的軟件提供商提供滿足專業(yè)治療性抗體研究人員速度和精度要求的解決方案。因此,我們大力投資開發(fā)以確保Geneious Biologics提供一流的技術(shù)來加速治療性抗體的發(fā)現(xiàn),“Bendtsen博士說。

下載白皮書 - 針對專業(yè)治療性抗體發(fā)現(xiàn)的強(qiáng)大生物信息學(xué)支持。下載地址:https://www.geneious.com/biologics/resources/

關(guān)于Geneious Biologics

Geneious Biologics是下一代云軟件解決方案,與行業(yè)合作伙伴合作,用于商業(yè)抗體發(fā)現(xiàn)和篩選。該平臺通過現(xiàn)代直觀,用戶友好的網(wǎng)頁界面提供,在安全的云計算基礎(chǔ)架構(gòu)中提供完全托管的數(shù)據(jù)平臺和信息系統(tǒng)。有關(guān)Geneious Biologics的更多信息,請?jiān)L問www.geneiousbiologics.com。

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